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图神经网络模型预测和解释离子液体毒性的研究
冯海军, 章冰璇, 周健
化工学报    2025, 76 (1): 93-106.   DOI:10.11949/0438-1157.20240663
摘要   (147 HTML12 PDF(pc) (4371KB)(222)  

离子液体对环境有潜在毒性,为了解其毒性机制,建立了三种传统机器学习(支持向量机,随机森林,多层感知机)和三种图神经网络(图注意力网络,消息传递神经网络,图卷积模型)模型,预测离子液体对大鼠IPC-81细胞等4种活生物体的毒性。凭借分子结构信息,图卷积模型在4个数据集中的RMSE和MAE均最低,R2均最高,因此,图卷积模型在预测离子液体毒性上更优越。同时,基于图卷积模型,建立毒性解释模型,从数据驱动上来分析原子基团对毒性的贡献。阳离子的芳香环和长烷基链会产生毒性,S+、P+、N+、NH+等原子基团会显著增强离子液体的毒性,而P-、F、B-、C等原子基团会有效降低离子液体的毒性。该发现可为快速筛选和开发更绿色低毒型离子液体提供理论依据。


数据集评估指标SVMRFMLPGATMPNNGCM
大鼠白血病细胞(IPC-81)RMSE0.6870.6550.6400.5190.4860.457
MAE0.5100.4360.4670.3790.3530.325
R20.6830.7060.6880.7640.7870.867

对乙酰胆碱酯酶

(AChE)

RMSE0.2290.2860.2430.2950.2460.229
MAE0.1280.1700.1560.2100.1710.184
R20.8140.7460.8250.7160.8220.830

大肠杆菌

E. coli

RMSE0.5450.5470.6650.6480.6100.396
MAE0.3960.4070.4620.4710.4170.324
R20.8320.8110.7750.7600.7730.880

费氏弧菌

Vibrio fischeri

RMSE0.7390.7240.6580.7320.6960.591
MAE0.5240.4600.4760.5240.4920.441
R20.7380.7530.7790.7040.7420.825
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表1 不同模型在不同数据集上的毒性预测性能表现
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